Согласно приказу Министерства инфраструктуры Украины от 19 марта 2013 года № 163 «О мерах по реорганизации государственных предприятий морского транспорта и образовании ГП «Администрация морских портов Украины» (АМПУ) наравне с другими было реорганизовано и государственное предприятие «Измаильский морской торговый порт».
Реорганизация произошла путем выделения стратегических объектов портовой инфраструктуры (по определению Закона «О морских портах Украины» -- в том числе, и объектов недвижимого имущества) в соответствии с распределительными балансами и образованием вследствие этого ГП «АМПУ».
Вместе с передачей объектов недвижимого имущества по акту приема-передачи имущества, имущественных прав и обязательств от 13 июня 2013 года с баланса ГП «ИЗМ МТП» на баланс ГП «АМПУ» по Земельному кодексу Украины в ГП «АМПУ» вместе с недвижимым имуществом перешло и право постоянного пользования земельными участками, на которых это имущество находится.